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Master 2 "Microbiologie, Environnement, Santé"
UPMC - MNHN

Propositions stages 2014-2015

 Titre

 Laboratoire

Responsable

 Lien

Fonctionnement écologique de lacs oligotrophes stratifiés 

UMR 6553 ECOBIO CNRS/Université de Rennes 1 

Myriam Bormans

Cédric wolf

1

Rôle des métabolites secondaires dans les interactions entre organismes planctoniques

UMR 6553 ECOBIO CNRS/Université de Rennes 1, University of Southern Denmark 

E. Briand, M. Bormans,

A. Pannard,

C. Wiegand

 

2

Thermophysiologie et adaptation à la niche écologique chez les
cyanobactéries du genre Synechococcus 

UMR UPMC-CNRS 7144 Adaptation et Diversité en
environnement Marin, Station Biologique de Roscoff

Christophe Six

3

Biominéralisation et consolidation de la pierre avec le système KBYO : étude de faisabilité 

Laboratoire de Recherche des Monuments Historiques (LRMH), Champs sur Marne 

Faisl Bousta

Jean-Didier Mertz

4

Dessalements des pierres par la dégradation des sulfates par voie bactérienne : étude de faisabilité 

Laboratoire de Recherche des Monuments Historiques (LRMH), Champs sur Marne 

Faisl Bousta

Véronique Vergès-Belmin

5

STAGE POURVU

Flexibilité de l’association entre les moules hydrothermales et leurs bactéries
symbiotiques méthanotrophes et sulfoxydantes : étude comparée de
Bathymodiolus azoricus et B. puteoserpentis

UMR 7208 BOREA équipe Adaptation aux Milieux Extrêmes, UPMC, PARIS 

Sébastien DUPERRON 

6

STAGE POURVU

Perturbations chimique et enzymatique de la signalisation quorum-sensing de
phytopathogènes bactériens

Institut des Sciences du Végétal 

Denis Faure 

7

STAGE POURVU

Validation de l’approche biocapteur luminescent Ostreococcus tauri pour la détection de polluants dans l’environnement marin

Laboratoire d’Océanographie Microbienne, UMR 7621 CNRS-UPMC, Banyuls/mer

 Fabien Joux

8

Développement d’une technique de transfert d’ADN par transformation chez différentes espèces de vibrios pathogènes d’invertébrés marins

Laboratoire de Biologie Intégrative des Modèles Marins-LBI2M-UMR8227

Station Biologique de Roscoff

 Yannick Labreuche

9

ADAPTATION ET RESILIENCE D’ORGANISMES SOUMIS A UNE PRESSION METALLIQUE CHRONIQUE : IMPLICATIONS POUR LA BIOSURVEILLANCE DES MILIEUX AQUATIQUES

Irstea d'Antony (92), UR Hydrosystèmes et Bioprocédés

Jeremie Lebrun

Llise Fechner

10

Etude expérimentale de l’impact de la disponibilité en carbone et en fer pour les bactéries hétérotrophes à l’aide de mutants et bio-rapporteur

Laboratoire d’Océanographie Microbienne, Observatoire Océanologique de Banyuls

 Ingrid Obernosterer

11

Patron et vitesse d’évolution des niches écologiques des bactéries du sol ; incidence sur leurs résistances à des stress environnementaux contrastés

Ecologie Microbienne Lyon UMR 5557 CNRS UCBL USC 1364 INRA, Villeurbanne

 Thomas Pommier

12

STAGE POURVU

Effets de l’inoculation in planta de souches endophytes fongiques sur l’algue brune Laminaria digitata en condition de stress biotiques

Muséum National d'Histoire Naturelle. Unité MCAM, UMR 7245 CNRS

 Soizic Prado

13

STAGE POURVU

Développement de méthodes d’oxydation de polluants organiques persistants (POP) couplant un procédé d’oxydation chimique à la biodégradation par des
champignons telluriques saprotrophes

Université du Littoral Côte d’Opale ULCO Unité de Chimie Environnementale et Interactions sur le Vivant (UCEIV EA 4492)

 Catherine Rafin

14

Rôle de la matière organique sur la diversité structurale et fonctionnelle
des communautés bactériennes dans un écosystème aquatique artificiel

UMR 7618 iEES équipe Communautés microbiennes des milieux
continentaux

E. Rochelle-Newall

J. Leloup

15

STAGE POURVU

Rôle des cyanobactéries dans le cycle de l’azote du lac Dziani
(Mayotte)

Muséum National d’Histoire Naturelle UMR 7245 CNRS-MNHN Molécules de Communication et Adaptation des Micro-organismes

 Cécile BERNARD

16

Impact de la fréquence de désinfection sur la survie de Listeria monocytogenes dans les conditions rencontrées dans les ateliers agro-alimentaires

Laboratoire de Sécurité des Aliments de l’Agence Nationale de Sécurité Sanitaire
de l’alimentation, de l’environnement et du travail, Maison Alfort

 Olivier Firmesse

17

PHAGES STX : OCCURRENCE DANS LES ENVIRONNEMENTS ALIMENTAIRES ET IMPACT DE LEUR MOBILITE SUR LE DIAGNOSTIC MICROBIOLOGIQUE

Laboratoire de Sécurité des Aliments de l’Agence Nationale de Sécurité Sanitaire
de l’alimentation, de l’environnement et du travail, Maison Alfort

Ludivine Bonanno

Frédéric Auvray

18

Analyse de la diversité génétique des souches de Listeria monocytogenes en Europe

Laboratoire de Sécurité des Aliments de l’Agence Nationale de Sécurité Sanitaire
de l’alimentation, de l’environnement et du travail, Maison Alfort

 Benjamin Félix

19

STAGE POURVU

Effets de la température et de la photopériode sur le déclenchement du bloom phytoplanctonique printanier

Laboratoire d’Océanographie Microbienne, Observatoire Océanologique de Banyuls

François-Yves Bouget

20

STAGE POURVU

Analyse et prédiction des effets de pesticides sur des processus microbiens des sols : utilisation de l’outil TYPOL

UMR Ecologie fonctionnelle
et écotoxicologie des agroécosystèmes INRA, Centre de Recherche de Versailles-­‐Grignon

 Crouzet Olivier

21

Etude des mécanismes moléculaires de colonisation des produits de construction par les micromycètes

CSTB Direction Santé Confort / Division Agents Biologiques et Aérocontaminants
Champs-sur Marne

 Isabelle LACAZE

22

Étude en microcosme du comportement de L. monocytogenes et de Salmonella Derby dans du sol amendé en lisier porcin

 IRSTEA centre de Rennes

 Jérémy Desneux

23

Interactions bactéries pathogènes-amibes dans les réseaux d’eau potable

Equipe Microbiologie de l'Eau Lab. Ecologie et Biologie des Interactions, UMR CNRS 7267
Poitiers

 Yann Héchard

24

Les bactéries protectrices du phytoplancton ? Mesure du stress toxique associé aux
resuspensions sédimentaires sur des communautés microbiennes simplifiées

 Laboratoire Ecologie des Systèmes Marins Côtiers ECOSYM - UMR 5119
SMEL, Station biologique, Sète

 Eric Fouilland

25

DIVERSITE DES EMPREINTES METABOLOMIQUES EN LIEN AVEC LE POTENTIEL TOXINOGENE CHEZ LE CHAMPIGNON PHYTOPATHOGENE FUSARIUM GRAMINEARUM

INRA - UPR 1264.01
Unité de Recherche MYCSA - Mycologie et Sécurité Alimentaire Bâtiment Qualis – CR Bordeaux-Aquitaine 

 Marie FOULONGNE-ORIOL

26

STAGE POURVU

Impact de la diversité des
Graminées et ligneux de
savane sur la diversité microbienne et le fonctionnement des sols : cycle de l’azote

UMR 7618 iEES équipe Communautés microbiennes des milieux continentaux

J.C. Lata

J. Leloup

27

Ecophysiologie des cyanobactéries
productrices d’anatoxine-a

Laboratoire LIED UMR CNRS 8236, Université Paris Diderot

A. Méjean

28

Caractérisation de la
capacité d’un écosystème à produire le gaz à effet de serre N2O

Irstea UR HBAN, Antony

Jean-­‐Jacques Pernelle

29

Caractérisation du rôle
inducteur du Fer et de
l’oxygène dans la croissance
filamenteuse de Sphaerotilus natans

 Irstea UR HBAN, Antony

 Jean-­‐Jacques Pernelle

30

STAGE POURVU

Influence du tassement des sols forestiers sur les activités
méthanogènes et méthanotrophes

Institut d’Ecologie et des Sciences de l’Environnement, Créteil

 Thomas Lerch

31

Etude de la dynamique des pathogènes lors du stockage de digestats issus de la
méthanisation : influence de déterminants biotiques et de la biodisponibilité de la
matière organique

Laboratoire de Biotechnologie de l’Environnement (LBE)
Avenue des Etangs - 11100 Narbonne, France

 Géraldine Maynaud

32

Evaluation du rôle du microbiote intestinal dans l'efficacité digestive du lapin et du porc

INRA – UMR TANDEM, Auzeville

Olivier ZEMB

33

30/06/17

Traductions :