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Master 2 "Microbiologie, Environnement, Santé"
UPMC - MNHN

Propositions stages MES 2017-2018

 

Titre

Laboratoire

Responsable

Lien

STAGE POURVU

Rôle des amibes environnementales dans la survie et la transmission de

mycobactéries pathogènes

Ecologie et Biologie des Interactions (EBI) UMR CNRS 7267, Université de Poitiers

Yann HECHARD

1

- Certification ISO 14001 version 2015.

- Evaluation de l’exposition aux principes actifs et son effet sur la santé des salariés

Sanofi Tunisie, 34 Avenue de Paris 2033 Mégrine. Tunisie

Imen BEN DHIA

=> prendre contact pour avoir des précisions sur les propositions

2

Unravelling the microbial carbon pump in the ocean: production and recycling of dissovled organic matter by marine bacteria

Laboratoire d’Océanographie Microbienne (LOMIC) UMR7621, Banyuls/mer

Eva ORTEGA-RETUERTA

3

Recherche des mécanismes d’influx et d’efflux de la cylindrospermopsine dans des modèles cellulaires humains.

Laboratoire ANSES de Fougères

Antoine HUGUET

4

Rôle des glycoprotéines couches S dans les interactions bactéries / métaux

UMR 7245 CNRS/MNHN, Molécules de Communication et Adaptation des
Microorganismes, MNHN Paris

Adrienne KISH Séverine ZIRAH

5

Dégradation de la fraction lignine par des consortia microbiensLaboratoire d’Ingénierie des Systèmes Biologiques et des Procédés
LISBP – INSA Toulouse
Guillermina HERNANDEZ-RAQUET 6
Développement d’outils analytiques innovants pour la détection rapide d’un pathogène
commun en aquaculture et aquariologie : Aeromonas salmonicida spp. salmonicida,
l’agent de la furonculose
Equipe Biocapteur Analyse Environnement - Perpignan
LBBM: Laboratoire de Biodiversité et Biotechnologies Microbiennes
USR3579 Banyuls sur Mer UPMC-CNRS

Lise BARTHELMEBS

Raphaël LAMI

7

STAGE POURVU

Développement d’outils de biologie quantitative en vue de la caractérisation du réseau mycélien
chez les champignons filamenteux
Podospora anserina et Aspergillus fumigatus

Laboratoire Interdisciplinaire des Energies de Demain (LIED) UMR 8236 – Equipe
Biologie et Biotechnologie des Champignons (B2C), Paris
Florence CHAPELAND-LECLERC 8
Impact du nitrate dans la résistance à un champignon nécrotrophe Botrytis cinereaInstitut Jean-Pierre Bourgin, INRA Centre de Versailles-Grignon, route de St Cyr,
78026 Versailles
 Marie-Christine SOULIE 9
Vers une nouvelle méthode moléculaire pour établir le lien entre les virus
d’archées et leur hôte au sein d’écosystèmes de digestion anaérobie
Irstea, Centre d’Antony, UR Hydrosystèmes et Bioprocédés (HBAN) Ariane BIZE 10
Contribution des bactéries magnétotactiques à la formation de phases minérales phosphatées
et influence des paramètres environnementaux
Institut de Mineralogie, Physique des Matériaux et Cosmochimie (IMPMC), CNRS,
MNHN et UPMC

Elodie DUPRAT,

Karim BENZERARA

 11

STAGE POURVU

Utilisation du bivalve Dreissena polymorpha comme bioindicateur de présence de polluants biologiques dans les milieux aquatiques : évaluation des capacités d’accumulation de cyanotoxines et de protozoaires

Unité Stress Environnementaux et BIOsurveillance des milieux aquatiques, UMR_I 02 INERIS-URCA-ULH SEBIO,
Université de Reims Champagne-Ardenne (URCA)

Aurélie BIGOT

Emilie LANCE

12

STAGE POURVU

Synergie entre matière organique d’origine phytoplanctonique et communautés microbiennes libres et attachées

 UMR 7208 BOREA, 61 rue Buffon, 75005 Paris

Dominique LAMY

Julie LELOUP

 13

Agrégats biogéniques dans les sols: impact sur la dynamique des microorganismes et la stabilisation de la matière organique

UMR 7619 Métis équipe Biogéochimie, 4, place Jussieu, 75005 Paris

Katell QUENEA

Julie LELOUP

14

Analyse de la dynamique temporelle des communautés microbiennes libres et attachées en milieu aquatique de part l’utilisation de réseaux de co-occurrence

UMR 7618 iEES équipe Ecologie intégrative : des mécanismes aux services
écosytémiques (EMS), 4, place Jussieu, 75005 Paris

Julie LELOUP

Lucie BITTNER

 15

Impact de différents stress rencontrés en entreprise de transformation du poisson sur la viabilité et la croissance de Listeria monocytogenes et de la flore annexeANSES, Boulogne sur Mer

Thomas BRAUGE

 

16

Voir offre N°99308

 

Impact de la présence d'une couverture de glace sur les communautés microbiennes planctoniques et sédimentaires d'une rivière canadienne en hiver

Labo Charette, Institut de Biologie Intégrative et des Systèmes (IBIS) - Université Laval, Québec, Canada

Perrine CRUAU,

Manuel J. RODRIGUEZ-PINZON

 17

Rôle de la diversité dans la stabilité des écosystèmes  aquacoles: fonctionnement d’un système intégré multitrophique face à une perturbation environnementale climatique

UMR MARBEC Biodiversité Marine, Exploitation & Conservation, Station IFREMER, Sète

Emmanuelle ROQUE

 18

 Dynamiques microbiennes et transferts d’éléments traces métalliques à

l’interface eau-sédiments

PROTEE/  MIO

Université de Toulon, Avenue de l’université, BP 20132, 83957 LA GARDE Cedex

Benjamin MISSON

 19

Etude in vitro de l’usage de Fluoroquinolone (Ciprofloxacine) à dose thérapeutique sur la virulence des E. coli Necrotoxigenic (NTEC) productrices de β lactamases à spectre élargi (BLSE)Unité Antibiorésistance et Virulence Bactériennes à l’Anses de Lyon, 31, avenue Tony Garnier. 69364 LYON Cedex 07 Charlotte VALAT 20
Estimation of the cultivability of gut microbesUMR GenPhySE (INRA Toulouse) Olivier ZEMB 21
Effets mélange des pesticides sur les fonctions écologiques des algues et
cyanobactéries, dans les sols agricoles

INRA ECOSYS,

Centre INRA de Versailles, RD-10 , 78026 Versailles

 Olivier CROUZET 22
Étude des mécanismes moléculaires et physiologiques impliqués dans la réponse à des
herbicides et antifoulings chez la microalgue marine Tetraselmis suecica
Laboratoire d’Ecotoxicologie Ifremer de Nantes

Rossana SUSSARELLU

Sabine STACHOWSKI-HABERKORN

 23
Utilisation de la phagothérapie pour lutter contre une bactérie
phytopathogène de laitue : Xanthomonas hortorum pv. Vitians
Laboratoire de Microbiologie Signaux et Microenvironnement,
Faculté des Sciences et Techniques, Université de Rouen
 Laurent QUILLET 24

STAGE POURVU

Répartition et caractérisation de Cryptocotyle spp., parasites potentiellement
zoonotiques dans les produits de la pêche

Laboratoire de sécurité des aliments/ ANSES, Boulogne sur Mer Mélanie GAY 25

Reconstruction du réseau métabolique d’une bactérie phytopathogène

INRA, Toulouse (Castanet Tolosan)

Caroline BAROUKH, Ludovic COTTRET

 26

STAGE POURVU

Etude de la production des métabolites secondaires produits par différentes souches de cyanobactéries (Planktothrix spp.) au cours de leur cycle de croissance : suivi ciblé et nonciblé par HRMS

UMR 7245 CNRS/MNHN « Molécules de Communication et adaptation des microorganismes », MNHN, Paris

 Benjamin MARIE

 27

Etude des déterminants génétiques et génomiques d'un champignon pathogène permettant son adaptation à une espèce non hôte, la moutarde d'Abyssinie

INRA UMR BIOGER, équipe Effecteurs et Pathogenèse chez Leptosphaeria
maculans, Thiverval-Grignon

 Jessica SOYER

 28

STAGE POURVU

Biological effects of the subinhibitory concentrations of bactericidal antibiotics on bacteria

INSERM, Equipe Robustness and Evolvability of Life, Inserm u1001, Paris

 Ivan MATIC

 29

Effet de différentes conditions de salinité sur la physiologie et la production toxinique
de souches acclimatées de Microcystis aeruginosa

Laboratoire Phycotoxines (PHYC), IFREMER - Centre Atlantique, Nantes

Maxime Georges des AULNOIS

Zouher AMZIL

 30

Sur le mystère du bilan océanique d’azote encore non bouclé et comment les organismes diazotrophes pourraient l’équilibrer: Analyse du contrôle par la ressource en phosphoreLaboratoire d'Océanographie de Villefranche (LOV), UMR 7093, Observatoire Océanologique de Villefranche-Sur-Mer

Sophie RABOUILLE

Pascal CLAQUIN

Solange DUHAMEL

 31
Optimisation de la synthèse de caroténoïdes chez Ostreococcus tauri par ingénierie génétique de la lycopène cyclaseLaboratoire d’Océanographie Microbienne, Observatoire de Banyuls sur Mer,

François-Yves BOUGET

Jean-Baptiste GUYON

 32
Biodiversité des microbiomes du tractus intestinal des poissons coralliens: variabilité,
structuration et évolution
Marine biodiversity, Exploitation and Conservation
(MARBEC), UMR CNRS 9190
Université de Montpellier
 Thierry BOUVIER33

STAGE POURVU

Contribution à la mise au point de méthodes de biocontrôle de la contamination du café par l'ochratoxine A

 CIRAD, Montpellier

Catherine BRABET

Noël DURAND

 34

STAGE POURVU

Implication du quorum sensing dans la virulence des Vibrios responsables des mortalités d’huitres en Méditerranée

LBBM – Laboratoire de Biodiversité et Biotechnologies microbiennes, UPMC, Banyuls/Mer

IHPE – Interactions Hôtes Pathogènes Environnement – Université de Montpellier, Ifremer

Raphaël LAMI

Delphine DESTOUMIEUX GARZON

 35

Etude de la dynamique de la diversité bactérienne lors d’un bloom phytoplanctonique en milieu
arctique et du potentiel de souches bactériennes cultivables à dégrader la matière organique excrétée
par différentes espèces de phytoplancton arctiques
 LOMIC - Laboratoire d'Océanographie Microbienne, CNRS, UPMC, Banyuls sur mer Fabien JOUX 36

Apport de l’ADN ancien dans l’étude de l’émergence
et de l’évolution des bactéries pathogènes des cultures

 CIRAD – UMR PVBMT, St Pierre de la Réunion

 Adrien RIEUX

 37

Purification et isolement des ovatoxines produites par le dinoflagellé benthique Ostreopsis cf. ovataLaboratoire Phycotoxines (PHYC), IFREMER - Centre Atlantique, Nantes Marin-Pierre GEMIN 38

STAGE POURVU

Etude du microbiote associé au poisson médaka lors d’expositions à des cyanotoxines

UMR 7245 MCAM, MNHN ParisSébastien DUPERRON 39
Est il nécessaire de d’isoler des phages et vibrios co-occurrents pour établir un
cocktail de phages efficaces ?
Laboratoire de Biologie Intégrative des Modèles Marins
UMR8227. Station Biologique de Roscoff
 Frédérique LEROUX 40

STAGE POURVU

Caractérisations structurale et physico-chimiques de deux cibles
thérapeutiques potentielles chez le parasite responsable du paludisme

Faculté de Pharmacie, Université Paris Descartes

Anais.MERCKX

Magali.BLAUD

 41

Implication des activités enzymatiques associées aux virus marins pour le cycle biogéochimique du carbone

UMR 7144 Adaptation et Diversité en Milieu Marin
Station Biologique de Roscoff

Anne-Claire BAUDOUX

42

Exploratory multivariate
analysis of multi-omics data
to decipher the mechanisms
of anaerobic digestion inhibition

Irstea – Hydrosystems and Bioprocesses research unit (HBAN) - BIOMIC
Team, Antony

Olivier CHAPLEUR

43

Exploration du mitome de différentes populations d’Armadillidium vulgareUniversité de Poitiers - UFR Sciences Fondamentales et Appliquées. Laboratoire Ecologie et Biologie des Interactions - UMR CNRS 7267 - Equipe Ecologie Evolution Symbiose

Isabelle MARCADÉ

Pierre GRÈVE

 44
Diversité des bactéries et archées thermo-acidophiles isolées d'un système hydrothermal volcanique marin : l'île de Vulcano (Italie) Equipe Microbiologie
Environnementale et Biotechnologie, (Mediterranean Institute of Oceanography, Université Marseille
 Gael ERAUSO45

STAGE POURVU

Effets de deux antibiotiques de la famille des sulfonamides sur des communautés microbiennes
périphytiques et sédimentaires : impacts écotoxicologiques et adaptation

 Irstea UR Riverly, Villeurbanne

 Stéphane PESCE

46

Cycle de la matière et variabilité environnementale en élevage larvaire de Litopenaeus stylirostris en Nouvelle-Calédonie

IFREMER Unité LEAD NC
Station de Saint Vincent
Boulouparis BP 2059
98846 Nouméa Cedex Nouvelle Calédonie

 Hugues LEMONNIER

47

Recherche d'une signature chimique des eaux dans les estuaires autour du
grand Nouméa (Dumbéa, Coulée, Rivière des Pirogues)

IFREMER Unité LEAD NC
Station de Saint Vincent
Boulouparis BP 2059
98846 Nouméa Cedex Nouvelle Calédonie

Hugues LEMONNIER

48

STAGE POURVU

Synthèse de nouveaux antibiotiques de type pyrrolamide par biologie de synthèse

Institut de Biologie Intégrative de la Cellule (I2BC), Université Paris-Saclay

Sylvie LAUTRU

49

Impact écotoxicologique de carbon-dots sur la cyanobactérie Planktothrix agardhii productrice de microcystines et sur son mutant non producteur de microcystines

UMR7245 CNRS-MNHN,

Eq. Cyanobactéries, cyanotoxines et environnement. Paris

 Roberta BRAYNER

 50

Criblage physiologique de cyanobactéries par micro-essais multicritèresLaboratoire GEPEA UMR CNRS 6144, Université Saint-Nazaire Catherine DUPRE 51
 Caractérisation et optimisation d'outils innovants pour évaluer le potentiel inhibiteur d'eaux résiduaires industrielles et prédire l'impact sur le fonctionnement des bioprocédés AMS Envolure et SIAPP, Colombes Solenn BELLATON52
    

17/10/17

Traductions :