Propositions stages MES 2018-2019
Titre |
Laboratoire |
Responsable |
Lien |
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STAGE POURVU Etude du lien entre microbiote intestinal et comportement alimentaire chez le rongeur dans le cadre d’un régime obésogène |
INRA, NuMeCan, équipe ALICE/NGB |
Gaëlle BOUDRY Mélanie FOUESNARD | 1 |
Stratégie de survie de Mycobacterium avium ssp. paratuberculosis au sein des amibes libres |
Laboratoire Ecologie et Biologie des Interactions. Université de Poitiers |
Yann HECHARD | |
Isolement et caractérisation de nouveaux organismes cellulaires : les bactéries prédatrices de bactéries (BALO) |
Institut National de la Recherche agronomique (INRA), UMR CARRTEL, Thonon les Bains |
Stéphan JACQUET | 3 |
STAGE POURVU Impact of host nitric response on pathogens and intestinal microbiota |
Microbiologie Alimentaire au Service |
Nalini RAMA RAO Marion LECLERC | |
Rôle de l’enveloppe cellulaire dans l’adaptation des archées aux milieux hypersalins |
Molécules de Communication et Adaptation des Microorganismes (MCAM), UMR 7245 CNRS - MNHN |
Adrienne KISH Séverine ZIRAH | |
STAGE POURVU Nitrate reduction (denitrification) in intertidal mudflats |
UMR ECOBIO 6553. Université de Rennes |
Céline ROOSE-AMSALEG Anniet LAVERMAN | |
L’Orange Carotenoid Protein, une protéine modulaire et photoactive chez les cyanobactéries |
I2BC/B3S/MROP, CEA Saclay |
Diana KIRILOVSKY Adjélé WILSON | |
The microbial carbon pump under different nutrient-limiting conditions |
Laboratoire d’Océanographie Microbienne, Observatoire Océanologique de Banyuls |
Eva ORTEGA-RETUERTA | |
Rôle d’OprF dans l’adaptation des P. fluorescens à leur environnement |
Laboratoire de microbiologie signaux et microenvironnement EA4312, Université de Rouen Normandie, Evreux |
Josselin BODILIS | |
Implication des représentants du phylum des Bathyarchaeota dans le cycle du méthane dans les sédiments marins associés à des migrations de fluides froids riches en méthane de pockmarks du canal du Mozambique |
Laboratoire des Environnements Extrêmes, IFREMER, Technopôle Brest-Iroise, Plouzané |
Laurent TOFFIN | |
Signaux microbiens dans la symbiose fixatrice d’azote Frankia/filao |
Laboratoire des Symbioses Tropicales et Méditerranéennes, Campus International de Baillarguet, Montpellier |
Alyssa CARRE-MLOUKA | |
Evaluation de l’efficacité de divers systèmes de conservation en cosmétique sur les bactéries responsables des odeurs axillaires |
THOR PERSONAL CARE, Division cosmétique, Compiègne |
thor.hpc@thor.com | |
Caractérisation des protéines impliquées dans la biominéralisation intracellulaire de carbonates de calcium par des cyanobactéries | Institut de Minéralogie, Physique des Matériaux et Cosmochimie |
Manuela DEZI BENZARARA Karim | 13 |
Biogeochemical conditions that control the formation and evolution of abnormal organic matter aggregations in areas sensitive to climate change | Département d’Océanographie Université de Concepcion-Chili |
Camila FERNANDEZ Veronica MOLINA | 14 |
STAGE POURVU Implication du quorum sensing dans la virulence des Vibrios associés aux mortalités d’huitres juvéniles en Méditerranée |
Laboratoire de Biodiversité et Biotechnologies microbiennes, Banyuls Interactions Hôtes Pathogènes Environnement – Université de Montpellier, Ifremer |
Raphaël LAMI Delphine DESTOUMIEUX GARZON | 15 |
Dynamiques microbiennes lors de la remise en suspension de sédiments marins portuaires et contributions au transfert de contaminants métalliques | Mediterranean Institute of Oceanography, Université de Toulon | Benjamin MISSON | 16 |
Dynamique et diversité du picoplancton marin côtier sous influence anthropique | Mediterranean Institute of Oceanography, Université de Toulon | Benjamin MISSON | 17 |
Phenotipic diversity withinh clonal phytoplankton cultures using single cell approach |
GENOPHY Lab, BIOM, Observatoire Océanologique de Banyuls sur mer Living Systems Institute, University of Exeter, UK |
Gwenael.PIGANEAU Stéfano PAGLIARA | |
Diversité, structure et dynamique des communautés microbiennes sous l’influence des facteurs environnementaux dans l’élevage larvaire de Litopenaeus stylirostris |
IFREMER Unité de Recherche LEAD Nouvelle Calédonie |
Nolwenn CALLAC | |
Influence de la température sur le microbiome de la tique Ixodes ricinus |
UMR BIPAR, Anses-Laboratoire de santé animale, Maisons-Alfort |
Thomas POLLET | |
Biodiversité, résilience et structuration des communautés bactériennes présentes dans les massifs coralliens de l’Atoll de Moruroa. |
UMR 7205, ISYEB, Equipe Biologie Intégrative des Populations et Evolution Moléculaire, Museum National d'Histoire Naturelle - EPHE, Paris |
Thierry WIRTH | |
STAGE POURVU Exploration des mécanismes de coexistence d’une cyanobactérie (Arthrospira fusiformis) et d’un picoeucaryote (Picocystis salinarum) d’un milieu extrême |
- Muséum National d’Histoire Naturelle - UMR MARBEC - Marine Biodiversity Exploitation and Conservation CNRS - UM - IRD - Ifremer |
Cécile BERNARD Marc TROUSSELLIER | |
Les acides aminés dans la symbiose Alnus-Frankia, du métabolisme azoté au contrôle du symbiote ? |
UMR 5557 Ecologie Microbienne - équipe Symbiose Actinorhizienne, université Lyon1 |
Anne-Emmanuelle HAY | |
Structure et fonctionnement des marais doux de la Charente-Maritime : compréhension du couplage benthos/pelagos dans les canaux secondaires de quelques typologies de marais |
Université de La Rochelle – LIENSs LPG-BIAF UMR-CNRS 6112, Université d'Angers |
Christine DUPUY Edouard METZGER | 24 |
STAGE POURVU Protection des plantes par ingénierie écologique du microbiote de la rhizosphère | Institut de biologie intégrative de la cellule - I2BC, Gif-sur-Yvette | Denis FAURE | 25 |
Etude des processus de transfert vers l'atmosphère des émissions biogéniques | Institut des Géosciences de l'Environnement, Grenoble |
Jean-Luc JAFFREZO Abdoulaye SAMAKE | 26 |
Colmatage biologique des systèmes de micro-irrigation : effet de la qualité de l’eau usée traitée | IRSTEA UMR G-EAU, Montpellier |
Kévin LEQUETTE Nassim AIT MOUHEB Nathalie WERY | 27 |
STAGE POURVU Identification taxonomique et étude chimique de nouvelles cyanobactéries benthiques de mangrove |
UMR7245 Molécules de Communication et Adaptation des Micro-organismes, MNHN, Paris |
Marie-Lise BOURGUET KONDRACKI | |
Caractérisation chez le symbionte Burkholderia insecticola de l'insecte Riptortus pedestris de fonctions bactériennes impliquées dans la résistance aux peptides antimicrobiens et dans la colonisation de l'organe symbiotique |
Institut de Biologie Intégrative de la Cellule, avenue de la Terrasse, Gif-sur-Yvette. |
Joy LACHAT Peter MERGAERT | |
La phage-thérapie peut elle constituée une alternative aux antibiotiques dans les élevages d’huîtres creuses Crassostrea gigas ? |
UMR CNRS-UPMC 8227, Biologie |
Frédérique LE ROUX | |
STAGE POURVU Analyse des communautés microbiennes et fongiques de sols urbains au pied des tilleuls à petites feuilles en alignement dans les rues parisiennes |
Institut d'Ecologie et des Sciences de l'Environnement. Sorbonne Université, Paris Diderot
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Patricia GENET Séverine PLANCHAIS | 31 |
Effet de la température, de la lumière et de l’origine géographique sur la production de toxines et de métabolites de Dinophysis sacculus | Laboratoire Phycotoxines (PHYC), IFREMER – Centre Atlantique, Nantes |
Véronique SECHET Sylvain GAILLARD | 32 |
Les microalgues marines en anoxie : diversité des métabolismes et interaction entre communautés | UMR Marbec (Marine Biodiversity Exploitation Conservation). Station Ifremer, Sète | Ariane ATTEIA | 33 |
The use of genetic tools in order to understand how heterotrophic bacteria can cope under Fe-limitation |
Laboratoire d’Océanographie Microbienne, Observatoire Océanologique de Banyuls |
Stéphane BLAIN Coco KOEDOODER | |
STAGE POURVU
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Les acides aminés dans la symbiose Alnus-Frankia, du métabolisme azoté au contrôle du symbiote ? |
UMR 5557 Ecologie Microbienne, Université Lyon1 |
Anne-Emmabuelle HAY | |
Production du DMSP et de STXs en réponse à des variations de température et salinité chez A. minutum et A. catenella |
Laboratoire Phycotoxines (PHYC), IFREMER – Centre Atlantique, Nantes |
Amandine CARUANA Solène GEFFROY | |
Traits d’histoire de vie de différentes espèces de Botryosphaeriacea en France (résistance aux fongicides, mycovirus) : impact sur la fitness | INRA, UMR SAVE, 1065, 71 avenue E Bourlaux, CS 20032, 33882 Villenave d’Ornon cédex | Marie-France CORIO-COSTET | 38 |
Mangroves : quels indicateurs microbiens pour la directive cadre sur l’eau (DCE) ? |
Institut Méditerranéen d’Océanologie, Bâtiment Océanomed, Campus de Luminy, Marseille |
Cécile MILITON Philippe CUNY | |
STAGE POURVU Réponse membranaire des bactéries Gram négatives aux conditions environnementales : évaluation des acides gras 3-hydroxylés comme marqueurs de température et de pH dans les sols |
METIS Milieux environnementaux, Transferts et Interactions dans les hydrosystèmes et les Sols, Sorbonne Université |
Sylvie COLLIN | 40 |
Une communauté au sein d’une communauté: le cas du microbiote associé aux mouches des fruits de l’île de la Réunion |
MNHN, UMR ISYEB |
Nathalie BECKER | |
Détermination de la dynamique bactériologique en Marne |
LEESU, Université Paris Créteil Est |
Auréile JANNE | |
STAGE POURVU Development of a method to study growth limits of Listeria monocytogenes at low temperature | Anses, Laboratoire de sécurité des aliments de Maisons Alfort | Lena FRITSCH | 43 |
Etude de l’influence du microbiote de l’huître Crassostrea gigas sur ses capacités immunitaire |
Laboratoire des Interaction-Hôte-Pathogènes-Environnement, UMR5244, Perpignan |
Céline COSSEAU Eve TOULZA | |
Evaluation du potentiel tératogène du glyphosate sur les diatomées benthiques d’eau douce |
LIEC - Laboratoire Interdisciplinaire des Environnements Continentaux, UMR 7360 CNRS - Université de Lorraine, Metz |
Martin LAVIALE Vincent FELTEN | |
Effet de la colonisation microbienne sur l'accumulation de métaux dans les mcroplastiques en milieu marin |
Laboratoire MAPIEM -EA 4323- |
Jean-François BRIAND | |
Effet de la durée d’exondation sur le microbiote de l’huître creuse, Crassostrea gigas |
LEMAR, IUEM, Technopôle Brest-Iroise, Plouzané |
Gwenaelle LEBLAY Clément OFFRET | |
Comparaison du Comportement trophique et de la Symbiose au cours du Développement chez les crevettes juvéniles entre Rimicaris exoculata et Rimicaris chacei | Laboratoire de Microbiologie des Environnements Extrêmes, Ifremer de Brest |
Marie Anne CAMBON-BONAVITA Marie.Anne.Cambon @ ifremer.fr Pierre METHOU | 48 |
Exploration of the potential physiological functions of the SurR regulator at high pressures in Thermococcus barophilus MP | Laboratoire de microbiologie des environnements extrêmes LM2E, UMR6197, Ifremer (Centre de Brest), Institut Universitaire Européen de la Mer (IUEM/UBO) |
Jordan HARTUINANS Yann MOLIC Mohamed JEBBAR | 49 |
Genomics-guided chemical inverstigation of endophytic streptomyces for new |
Unité Molécules de Communication et Adaptation des Microorganismes |
Yanyan LI | |
STAGE POURVU Effet d’un traitement par faecalibacterium prausnizii sur les atteintes radio-induites du côlon: Potentialisation de l’effet thérapeutique des cellules stromales mésenchymateuses |
IRSN - Institut de radioprotection et de sûreté nucléaire, LRMed - Laboratoire de radiobiologie des expositions médicales, Fontenay aux Roses |
Alexandra SEMONT |
51 |
Développement de nouveaux produits fermentés | Danone, Palaiseau | 52 | |
STAGE POURVU Inférence de la dynamique des populations de Mycobacterium tuberculosis et de son |
UMR 7205, ISYEB, Equipe Biologie Intégrative des Populations et Evolution Moléculaire, Museum National d'Histoire Naturelle - EPHE, Paris |
Thierry Wirth | |
Etude d’association à l’échelle du génome du succès épidémique |
UMR 7205, ISYEB, Equipe Biologie Intégrative des Populations et Evolution Moléculaire, Museum National d'Histoire Naturelle - EPHE, Paris |
Thierry Wirth | |
STAGE POURVU Analyse de l’infection virale par l’utilisation de la méthode du « Stable Isotope Probing » (SIP) | Irstea, unité de Recherche Hydrosystèmes et Bioprocédés, Antony | Ariane BIZE | 55 |
Utilisation de la lumière visible dans le développement d’un procédé de décontamination |
UMR PAM (Procédés Alimentaires et Microbiologiques) Equipe PMB, Agrosup Dijon |
Sébastien DUPONT Cédric GRANGETEAU | |
Etude des bactériophages de produits cidricoles |
Laboratoire MALIM (Matrices ALImentaires et Microbiotes), UR ABTE (Université de Caen Normandie, |
Marion DALMASSO Marina CRETENET | |
Impacts de stress représentatifs des procédés sur l’activité fermentaire de bactéries intestinales, nouveaux microorganismes d’intérêt |
Agrosup Dijon - UMR Procédés Alimentaires et Microbiologiques (PAM) |
Veronique JULLIAND | |
Cinétique d’évolution des communautés microbiennes des sols de la Réunion suite à un apport répété de Produits Résiduaires Organiques | INRA Dijon / UMR Agroécologie / Equipe Biocom |
Sophie BOURGETEAUSADET Frédéric FEDER | 59 |
Exploration des « hot spots » microbiologiques dans les interfaces |
Observatoire des Sciences de l’Univers de Rennes |
Julien FARASIN | |
Interactions microbiennes pour la vitamine B12 |
Laboratoire GEPEA CRTT Saint Nazaire LPBA Ifremer |
Anthony MASSÉ Charlotte NEF | 61 |
Biodégradation de l’éthanolamine dans les bâches industrielles : compréhension des phénomènes microbiens en jeu |
EDF - R&D - Laboratoire National d’Hydraulique et Environnement |
Marie BINET | |
Evaluation de la productivité (croissance, photosynthèse, biomasse) de lignées génétiquement modifiées de lycopène cyclase d’ Ostreococcus tauri |
Laboratoire d’Océanographie Microbienne, Observatoire Océanologique de Banyuls |
François-Yves BOUGET | |
The rhizospheric microbial community of an endemic cushion of the Kerguelen Islands: Role in the plant adaptation to extreme environment and its response to climate changes | ECOBIO CNRS-UMR 6553, campus de Beaulieu Bât. 14 A, 35042 Rennes Cedex Rennes | Cecile MONARD | 64 |
Rôle des microRNAs dans l’interaction plante-microbiome de la rhizosphère en |
ECOBIO CNRS-UMR 6553, campus de Beaulieu Bât. 14 A, 35042 Rennes CedexRennes |
Abdelhak EL AMRANI | |
Resistance of tardigrades to cyanotoxins |
Muséum national d'Histoire Naturelle UMR 7196 INSERM U1154 "Structure et Instabilité des Génomes" |
Emmanuelle DELAGOUTTE | |
STAGE POURVU Impact de la nutrition azotée de la plante sur les mécanismes de détoxication des formes | Institut Jean-Pierre Bourgin, INRA Centre de Versailles-Grignon, route de St Cyr, 78026 Versailles cedex | Marie-Christine SOULIE | |
STAGE POURVU Caractérisation fonctionnelle d’une diguanylate cyclase impliquée dans la formation de biofilms à l’interface alcane-eau par Marinobacter hydrocarbonoclasticus SP17 | IPREM - UMR 5254 UPPA/CNRS IBEAS, Pau | Régis GRIMAUD | 68 |
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