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Master 2 "Microbiologie, Environnement, Santé"
UPMC - MNHN

Propositions stages MES 2018-2019

Titre

Laboratoire

Responsable

Lien

STAGE POURVU

Etude du lien entre microbiote intestinal et comportement alimentaire chez le rongeur dans le cadre d’un régime obésogène

INRA, NuMeCan, équipe ALICE/NGB
35590 Saint-Gilles

Gaëlle BOUDRY

Mélanie FOUESNARD

1

Stratégie de survie de Mycobacterium avium ssp. paratuberculosis au sein des amibes libres

Laboratoire Ecologie et Biologie des Interactions. Université de Poitiers

Yann HECHARD

2

Isolement et caractérisation de nouveaux organismes cellulaires : les bactéries prédatrices de bactéries (BALO)

Institut National de la Recherche agronomique (INRA), UMR CARRTEL, Thonon les Bains

Stéphan JACQUET

3

STAGE POURVU

Impact of host nitric response on pathogens and intestinal microbiota

Microbiologie Alimentaire au Service
de la Santé. INRA Jouy en Josas

Nalini RAMA RAO

Marion LECLERC

4

Rôle de l’enveloppe cellulaire dans l’adaptation des archées aux milieux hypersalins

Molécules de Communication et Adaptation des Microorganismes (MCAM), UMR 7245 CNRS - MNHN

Adrienne KISH

Séverine ZIRAH

5

Nitrate reduction (denitrification) in intertidal mudflats

 UMR ECOBIO 6553. Université de Rennes

Céline ROOSE-AMSALEG

Anniet LAVERMAN

6

L’Orange Carotenoid Protein, une protéine modulaire et photoactive chez les cyanobactéries

 I2BC/B3S/MROP, CEA Saclay

Diana KIRILOVSKY

Adjélé WILSON

7

The microbial carbon pump under different nutrient-limiting conditions

Laboratoire d’Océanographie Microbienne, Observatoire Océanologique de Banyuls

Eva ORTEGA-RETUERTA

 8

Rôle d’OprF dans l’adaptation des P. fluorescens à leur environnement

Laboratoire de microbiologie signaux et microenvironnement EA4312, Université de Rouen Normandie, Evreux

Josselin BODILIS

9

Implication des représentants du phylum des Bathyarchaeota dans le cycle du méthane dans les sédiments marins associés à des migrations de fluides froids riches en méthane de pockmarks du canal du Mozambique

Laboratoire des Environnements Extrêmes, IFREMER, Technopôle Brest-Iroise, Plouzané

Laurent TOFFIN

10

Signaux microbiens dans la symbiose fixatrice d’azote Frankia/filao

Laboratoire des Symbioses Tropicales et Méditerranéennes, Campus International de Baillarguet, Montpellier

Alyssa CARRE-MLOUKA

11

Evaluation de l’efficacité de divers systèmes de conservation en cosmétique sur les bactéries responsables des odeurs axillaires

THOR PERSONAL CARE, Division cosmétique, Compiègne

thor.hpc@thor.com

12

Caractérisation des protéines impliquées dans la biominéralisation intracellulaire de carbonates de calcium par des cyanobactériesInstitut de Minéralogie, Physique des Matériaux et Cosmochimie

Manuela DEZI

BENZARARA Karim

13
Biogeochemical conditions that control the formation and evolution of abnormal organic matter aggregations in areas sensitive to climate changeDépartement d’Océanographie Université de Concepcion-Chili 

Camila FERNANDEZ

Veronica MOLINA

14

STAGE POURVU

Implication du quorum sensing dans la virulence des Vibrios associés aux mortalités d’huitres juvéniles en Méditerranée

Laboratoire de Biodiversité et Biotechnologies microbiennes, Banyuls

Interactions Hôtes Pathogènes Environnement – Université de Montpellier, Ifremer

Raphaël LAMI

Delphine DESTOUMIEUX GARZON

15
Dynamiques microbiennes lors de la remise en suspension de sédiments marins portuaires et contributions au transfert de contaminants métalliquesMediterranean Institute of Oceanography, Université de ToulonBenjamin MISSON16
Dynamique et diversité du picoplancton marin côtier sous influence anthropiqueMediterranean Institute of Oceanography, Université de ToulonBenjamin MISSON17

Phenotipic diversity withinh clonal phytoplankton cultures using single cell approach

GENOPHY Lab, BIOM, Observatoire Océanologique de Banyuls sur mer

Living Systems Institute, University of Exeter, UK

Gwenael.PIGANEAU

Stéfano PAGLIARA

 18

Diversité, structure et dynamique des communautés microbiennes sous l’influence des facteurs environnementaux dans l’élevage larvaire de Litopenaeus stylirostris

IFREMER Unité de Recherche LEAD Nouvelle Calédonie

Nolwenn CALLAC

19

Influence de la température sur le microbiome de la tique Ixodes ricinus

UMR BIPAR, Anses-Laboratoire de santé animale, Maisons-Alfort

Thomas POLLET

20

Biodiversité, résilience et structuration des communautés bactériennes présentes dans les massifs coralliens de l’Atoll de Moruroa.

UMR 7205, ISYEB, Equipe Biologie Intégrative des Populations et Evolution Moléculaire, Museum National d'Histoire Naturelle - EPHE,  Paris

Thierry WIRTH

21

STAGE POURVU

Exploration des mécanismes de coexistence d’une cyanobactérie (Arthrospira fusiformis) et d’un picoeucaryote (Picocystis salinarum) d’un milieu extrême

- Muséum National d’Histoire Naturelle
UMR 7245 CNRS-MNHN Molécules de Communication et Adaptation des Micro-organismesEq. Cyanobactéries, Cyanotoxines et Environnement, Paris

- UMR MARBEC - Marine Biodiversity Exploitation and Conservation CNRS - UM - IRD - Ifremer
UNIVERSITE DE MONTPELLIER

Cécile BERNARD

Marc TROUSSELLIER

22

Les acides aminés dans la symbiose Alnus-Frankia, du métabolisme azoté au contrôle du symbiote ?

UMR 5557 Ecologie Microbienne - équipe Symbiose Actinorhizienne, université Lyon1

Anne-Emmanuelle HAY

23

Structure et fonctionnement des marais doux de la Charente-Maritime : compréhension du couplage benthos/pelagos dans les canaux secondaires de quelques typologies de marais

Université de La Rochelle – LIENSs

LPG-BIAF UMR-CNRS 6112, Université d'Angers

Christine DUPUY

Edouard METZGER

24
Protection des plantes par ingénierie écologique du microbiote de la rhizosphèreInstitut de biologie intégrative de la cellule - I2BC, Gif-sur-YvetteDenis FAURE 25
Etude des processus de transfert vers l'atmosphère des émissions biogéniquesInstitut des Géosciences de
l'Environnement, Grenoble

Jean-Luc JAFFREZO

Abdoulaye SAMAKE

26
Colmatage biologique des systèmes de micro-irrigation : effet de la qualité de l’eau usée traitée IRSTEA UMR G-EAU, Montpellier

Kévin LEQUETTE

Nassim AIT MOUHEB

Nathalie WERY

27

STAGE POURVU

Identification taxonomique et étude chimique de nouvelles cyanobactéries benthiques de mangrove

UMR7245 Molécules de Communication et Adaptation des Micro-organismes, MNHN, Paris

Marie-Lise BOURGUET KONDRACKI

28

Caractérisation chez le symbionte Burkholderia insecticola de l'insecte Riptortus pedestris de fonctions bactériennes impliquées dans la résistance aux peptides antimicrobiens et dans la colonisation de l'organe symbiotique

Institut de Biologie Intégrative de la Cellule, avenue de la Terrasse, Gif-sur-Yvette.

Joy LACHAT

Peter MERGAERT

 29

La phage-thérapie peut elle constituée une alternative aux antibiotiques dans les élevages d’huîtres creuses Crassostrea gigas ?

UMR CNRS-UPMC 8227, Biologie
intégrative des modèles marins, Station Biologique de Roscoff

Frédérique LE ROUX

30

STAGE POURVU

Analyse des communautés microbiennes et fongiques de sols urbains au pied des tilleuls à petites feuilles en alignement dans les rues parisiennes

Institut d'Ecologie et des Sciences de l'Environnement. Sorbonne Université, Paris Diderot

 

Patricia GENET

Séverine PLANCHAIS

31
Effet de la température, de la lumière et de l’origine géographique sur la production de toxines et de métabolites de Dinophysis sacculusLaboratoire Phycotoxines (PHYC), IFREMER – Centre Atlantique, Nantes

Véronique SECHET

Sylvain GAILLARD

32
Les microalgues marines en anoxie : diversité des métabolismes et interaction entre communautésUMR Marbec (Marine Biodiversity Exploitation Conservation). Station Ifremer, SèteAriane ATTEIA33

The use of genetic tools in order to understand how heterotrophic bacteria can cope under Fe-limitation 

Laboratoire d’Océanographie Microbienne, Observatoire Océanologique de Banyuls

Stéphane BLAIN

Coco KOEDOODER

34

STAGE POURVU

 

 

 

35

Les acides aminés dans la symbiose Alnus-Frankia, du métabolisme azoté au contrôle du symbiote ?

 UMR 5557 Ecologie Microbienne, Université Lyon1

Anne-Emmabuelle HAY

36

Production du DMSP et de STXs en réponse à des variations de température et salinité chez A. minutum et A. catenella

Laboratoire Phycotoxines (PHYC), IFREMER – Centre Atlantique, Nantes

Amandine CARUANA

Solène GEFFROY

37

Traits d’histoire de vie de différentes espèces de Botryosphaeriacea en France (résistance aux fongicides, mycovirus) : impact sur la fitness

INRA, UMR SAVE, 1065, 71 avenue E Bourlaux, CS 20032, 33882 Villenave
d’Ornon cédex
Marie-France CORIO-COSTET38

Mangroves : quels indicateurs microbiens pour la directive cadre sur l’eau (DCE) ?

Institut Méditerranéen d’Océanologie, Bâtiment Océanomed, Campus de Luminy, Marseille

Cécile MILITON

Philippe CUNY

39

STAGE POURVU

Réponse membranaire des bactéries Gram négatives aux conditions environnementales : évaluation des acides gras 3-hydroxylés comme marqueurs de température et de pH dans les sols

METIS Milieux environnementaux, Transferts et Interactions dans les hydrosystèmes et les Sols, Sorbonne Université

 Sylvie COLLIN

 40

Une communauté au sein d’une communauté: le cas du microbiote associé aux mouches des fruits de l’île de la Réunion

MNHN, UMR ISYEB

Nathalie BECKER

 41

Détermination de la dynamique bactériologique en Marne

 LEESU, Université Paris Créteil Est

Auréile JANNE

 42

STAGE POURVU

Development of a method to study growth limits of Listeria monocytogenes at low temperature

Anses, Laboratoire de sécurité des aliments de Maisons AlfortLena FRITSCH 43

Etude de l’influence du microbiote de l’huître Crassostrea gigas sur ses capacités immunitaire

Laboratoire des Interaction-Hôte-Pathogènes-Environnement, UMR5244, Perpignan

Céline COSSEAU

Eve TOULZA

 44

Evaluation du potentiel tératogène du glyphosate sur les diatomées benthiques d’eau douce

LIEC - Laboratoire Interdisciplinaire des Environnements Continentaux, UMR 7360 CNRS - Université de Lorraine, Metz

Martin LAVIALE

Vincent FELTEN

 45

Effet de la colonisation microbienne sur l'accumulation de métaux dans les mcroplastiques en milieu marin

Laboratoire MAPIEM -EA 4323-
Ecologie microbienne & chimique des biofilms marins, Université de Toulon

Jean-François BRIAND

46

Effet de la durée d’exondation sur le microbiote de l’huître creuse, Crassostrea gigas

LEMAR, IUEM, Technopôle Brest-Iroise, Plouzané

Gwenaelle LEBLAY

Clément OFFRET

47

Comparaison du Comportement trophique et de la Symbiose au cours du Développement chez les crevettes juvéniles entre Rimicaris exoculata et Rimicaris chaceiLaboratoire de Microbiologie des Environnements Extrêmes, Ifremer de Brest

Marie Anne CAMBON-BONAVITA

Marie.Anne.Cambon @ ifremer.fr

Pierre METHOU

Pierre.Methou @ ifremer.fr

48
Exploration of the potential physiological functions of the SurR regulator at high pressures in Thermococcus barophilus MPLaboratoire de microbiologie des environnements extrêmes LM2E, UMR6197, Ifremer (Centre de Brest), Institut Universitaire Européen de la Mer (IUEM/UBO)

Jordan HARTUINANS

Yann MOLIC

Mohamed JEBBAR

49

Genomics-guided chemical inverstigation of endophytic streptomyces for new
antibiotic discovery

Unité Molécules de Communication et Adaptation des Microorganismes
(MCAM), UMR 7245 CNRS/MNHN, Paris

 Yanyan LI

50

STAGE POURVU

Effet  d’un  traitement  par  faecalibacterium  prausnizii  sur    les  atteintes  radio-induites  du  côlon: Potentialisation de l’effet thérapeutique des cellules stromales mésenchymateuses

IRSN - Institut de radioprotection et de sûreté nucléaire, LRMed - Laboratoire de radiobiologie des expositions médicales, Fontenay aux Roses

 Alexandra SEMONT

 51

Développement de nouveaux produits fermentés Danone, Palaiseau  52

STAGE POURVU

Inférence de la dynamique des populations de Mycobacterium tuberculosis et de son
paysage adaptatif sur la base d'évolution expérimentale et de simulations prédictives

UMR 7205, ISYEB, Equipe Biologie Intégrative des Populations et Evolution Moléculaire, Museum National d'Histoire Naturelle - EPHE, Paris

 Thierry Wirth

 53

Etude d’association à l’échelle du génome du succès épidémique
de souches de Mycobacterium tuberculosis multirésistantes
impliquées dans des épidémies à large échelle

UMR 7205, ISYEB, Equipe Biologie Intégrative des Populations et Evolution Moléculaire, Museum National d'Histoire Naturelle - EPHE, Paris

 Thierry Wirth

 54

STAGE POURVU

Analyse de l’infection virale par l’utilisation de la méthode du « Stable Isotope Probing » (SIP)

 Irstea, unité de Recherche Hydrosystèmes et Bioprocédés, Antony Ariane BIZE 55

Utilisation de la lumière visible dans le développement d’un procédé de décontamination

UMR PAM (Procédés Alimentaires et Microbiologiques)

Equipe PMB, Agrosup Dijon

Sébastien DUPONT

Cédric GRANGETEAU

 56

Etude des bactériophages de produits cidricoles

Laboratoire MALIM (Matrices ALImentaires et Microbiotes), UR ABTE (Université de Caen Normandie,

Marion DALMASSO

Marina CRETENET

57

Impacts de stress représentatifs des procédés sur l’activité fermentaire de bactéries intestinales, nouveaux microorganismes d’intérêt

Agrosup Dijon - UMR Procédés Alimentaires et Microbiologiques (PAM)

Veronique JULLIAND

58

Cinétique d’évolution des communautés microbiennes des sols de la Réunion suite à un apport répété de Produits Résiduaires OrganiquesINRA Dijon / UMR Agroécologie / Equipe Biocom

Sophie BOURGETEAUSADET

Frédéric FEDER

 59

Exploration des « hot spots » microbiologiques dans les interfaces
de mélange de fluides par imagerie microfluidique

Observatoire des Sciences de l’Univers de Rennes

 Julien FARASIN

 60

Interactions microbiennes pour la vitamine B12

Laboratoire GEPEA CRTT Saint Nazaire

LPBA Ifremer

Anthony MASSÉ

Charlotte NEF

 61

Biodégradation de l’éthanolamine dans les bâches industrielles : compréhension des phénomènes microbiens en jeu

EDF - R&D - Laboratoire National d’Hydraulique et Environnement
Groupe Chimie Microbiologie Eau et Environnement

 Marie BINET

 62

Evaluation de la productivité (croissance, photosynthèse, biomasse) de lignées génétiquement modifiées de lycopène cyclase d’ Ostreococcus tauri

Laboratoire d’Océanographie Microbienne, Observatoire Océanologique de Banyuls

 François-Yves BOUGET

 63

The rhizospheric microbial community of an endemic cushion of the Kerguelen Islands: Role in the plant adaptation to extreme environment and its response to climate changesECOBIO CNRS-UMR 6553, campus de Beaulieu Bât. 14 A, 35042 Rennes Cedex Rennes Cecile MONARD 64

 Rôle des microRNAs dans l’interaction plante-microbiome de la rhizosphère en
condition de stress abiotique.

ECOBIO CNRS-UMR 6553,

campus de Beaulieu Bât. 14 A, 35042 Rennes CedexRennes

 Abdelhak EL AMRANI

 65

 

Resistance of tardigrades to cyanotoxins

Muséum national d'Histoire Naturelle UMR 7196 INSERM U1154 "Structure et Instabilité des Génomes"

 Emmanuelle DELAGOUTTE

66

Impact de la nutrition azotée de la plante sur les mécanismes de détoxication des formes
actives de l'oxygène produites par un champignon Botrytis cinerea lors de l'infection
Institut Jean-Pierre Bourgin, INRA Centre de Versailles-Grignon, route de St Cyr,
78026 Versailles cedex
 Marie-Christine SOULIE

67

STAGE POURVU

Caractérisation fonctionnelle d’une diguanylate cyclase impliquée dans la formation de biofilms à l’interface alcane-eau par Marinobacter hydrocarbonoclasticus SP17

IPREM - UMR 5254 UPPA/CNRS IBEAS, Pau Régis GRIMAUD68

 

 

 

 

09/11/18

Traductions :