Propositions stages MES 2018-2019

Titre	Laboratoire	Responsable	Lien
STAGE POURVU Etude du lien entre microbiote intestinal et comportement alimentaire chez le rongeur dans le cadre d’un régime obésogène	INRA, NuMeCan, équipe ALICE/NGB 35590 Saint-Gilles	Gaëlle BOUDRY Mélanie FOUESNARD	1
Stratégie de survie de Mycobacterium avium ssp. paratuberculosis au sein des amibes libres	Laboratoire Ecologie et Biologie des Interactions. Université de Poitiers	Yann HECHARD	2
Isolement et caractérisation de nouveaux organismes cellulaires : les bactéries prédatrices de bactéries (BALO)	Institut National de la Recherche agronomique (INRA), UMR CARRTEL, Thonon les Bains	Stéphan JACQUET	3
STAGE POURVU Impact of host nitric response on pathogens and intestinal microbiota	Microbiologie Alimentaire au Service de la Santé. INRA Jouy en Josas	Nalini RAMA RAO Marion LECLERC	4
Rôle de l’enveloppe cellulaire dans l’adaptation des archées aux milieux hypersalins	Molécules de Communication et Adaptation des Microorganismes (MCAM), UMR 7245 CNRS - MNHN	Adrienne KISH Séverine ZIRAH	5
Nitrate reduction (denitrification) in intertidal mudflats	UMR ECOBIO 6553. Université de Rennes	Céline ROOSE-AMSALEG Anniet LAVERMAN	6
L’Orange Carotenoid Protein, une protéine modulaire et photoactive chez les cyanobactéries	I2BC/B3S/MROP, CEA Saclay	Diana KIRILOVSKY Adjélé WILSON	7
The microbial carbon pump under different nutrient-limiting conditions	Laboratoire d’Océanographie Microbienne, Observatoire Océanologique de Banyuls	Eva ORTEGA-RETUERTA	8
Rôle d’OprF dans l’adaptation des P. fluorescens à leur environnement	Laboratoire de microbiologie signaux et microenvironnement EA4312, Université de Rouen Normandie, Evreux	Josselin BODILIS	9
Implication des représentants du phylum des Bathyarchaeota dans le cycle du méthane dans les sédiments marins associés à des migrations de fluides froids riches en méthane de pockmarks du canal du Mozambique	Laboratoire des Environnements Extrêmes, IFREMER, Technopôle Brest-Iroise, Plouzané	Laurent TOFFIN	10
Signaux microbiens dans la symbiose fixatrice d’azote Frankia/filao	Laboratoire des Symbioses Tropicales et Méditerranéennes, Campus International de Baillarguet, Montpellier	Alyssa CARRE-MLOUKA	11
Evaluation de l’efficacité de divers systèmes de conservation en cosmétique sur les bactéries responsables des odeurs axillaires	THOR PERSONAL CARE, Division cosmétique, Compiègne	thor.hpc@thor.com	12
Caractérisation des protéines impliquées dans la biominéralisation intracellulaire de carbonates de calcium par des cyanobactéries	Institut de Minéralogie, Physique des Matériaux et Cosmochimie	Manuela DEZI BENZARARA Karim	13
Biogeochemical conditions that control the formation and evolution of abnormal organic matter aggregations in areas sensitive to climate change	Département d’Océanographie Université de Concepcion-Chili	Camila FERNANDEZ Veronica MOLINA	14
STAGE POURVU Implication du quorum sensing dans la virulence des Vibrios associés aux mortalités d’huitres juvéniles en Méditerranée	Laboratoire de Biodiversité et Biotechnologies microbiennes, Banyuls Interactions Hôtes Pathogènes Environnement – Université de Montpellier, Ifremer	Raphaël LAMI Delphine DESTOUMIEUX GARZON	15
Dynamiques microbiennes lors de la remise en suspension de sédiments marins portuaires et contributions au transfert de contaminants métalliques	Mediterranean Institute of Oceanography, Université de Toulon	Benjamin MISSON	16
Dynamique et diversité du picoplancton marin côtier sous influence anthropique	Mediterranean Institute of Oceanography, Université de Toulon	Benjamin MISSON	17
Phenotipic diversity withinh clonal phytoplankton cultures using single cell approach	GENOPHY Lab, BIOM, Observatoire Océanologique de Banyuls sur mer Living Systems Institute, University of Exeter, UK	Gwenael.PIGANEAU Stéfano PAGLIARA	18
Diversité, structure et dynamique des communautés microbiennes sous l’influence des facteurs environnementaux dans l’élevage larvaire de Litopenaeus stylirostris	IFREMER Unité de Recherche LEAD Nouvelle Calédonie	Nolwenn CALLAC	19
Influence de la température sur le microbiome de la tique Ixodes ricinus	UMR BIPAR, Anses-Laboratoire de santé animale, Maisons-Alfort	Thomas POLLET	20
Biodiversité, résilience et structuration des communautés bactériennes présentes dans les massifs coralliens de l’Atoll de Moruroa.	UMR 7205, ISYEB, Equipe Biologie Intégrative des Populations et Evolution Moléculaire, Museum National d'Histoire Naturelle - EPHE, Paris	Thierry WIRTH	21
STAGE POURVU Exploration des mécanismes de coexistence d’une cyanobactérie (Arthrospira fusiformis) et d’un picoeucaryote (Picocystis salinarum) d’un milieu extrême	- Muséum National d’Histoire Naturelle UMR 7245 CNRS-MNHN Molécules de Communication et Adaptation des Micro-organismesEq. Cyanobactéries, Cyanotoxines et Environnement, Paris - UMR MARBEC - Marine Biodiversity Exploitation and Conservation CNRS - UM - IRD - Ifremer UNIVERSITE DE MONTPELLIER	Cécile BERNARD Marc TROUSSELLIER	22
Les acides aminés dans la symbiose Alnus-Frankia, du métabolisme azoté au contrôle du symbiote ?	UMR 5557 Ecologie Microbienne - équipe Symbiose Actinorhizienne, université Lyon1	Anne-Emmanuelle HAY	23
Structure et fonctionnement des marais doux de la Charente-Maritime : compréhension du couplage benthos/pelagos dans les canaux secondaires de quelques typologies de marais	Université de La Rochelle – LIENSs LPG-BIAF UMR-CNRS 6112, Université d'Angers	Christine DUPUY Edouard METZGER	24
Protection des plantes par ingénierie écologique du microbiote de la rhizosphère	Institut de biologie intégrative de la cellule - I2BC, Gif-sur-Yvette	Denis FAURE	25
Etude des processus de transfert vers l'atmosphère des émissions biogéniques	Institut des Géosciences de l'Environnement, Grenoble	Jean-Luc JAFFREZO Abdoulaye SAMAKE	26
Colmatage biologique des systèmes de micro-irrigation : effet de la qualité de l’eau usée traitée	IRSTEA UMR G-EAU, Montpellier	Kévin LEQUETTE Nassim AIT MOUHEB Nathalie WERY	27
STAGE POURVU Identification taxonomique et étude chimique de nouvelles cyanobactéries benthiques de mangrove	UMR7245 Molécules de Communication et Adaptation des Micro-organismes, MNHN, Paris	Marie-Lise BOURGUET KONDRACKI	28
Caractérisation chez le symbionte Burkholderia insecticola de l'insecte Riptortus pedestris de fonctions bactériennes impliquées dans la résistance aux peptides antimicrobiens et dans la colonisation de l'organe symbiotique	Institut de Biologie Intégrative de la Cellule, avenue de la Terrasse, Gif-sur-Yvette.	Joy LACHAT Peter MERGAERT	29
La phage-thérapie peut elle constituée une alternative aux antibiotiques dans les élevages d’huîtres creuses Crassostrea gigas ?	UMR CNRS-UPMC 8227, Biologie intégrative des modèles marins, Station Biologique de Roscoff	Frédérique LE ROUX	30
STAGE POURVU Analyse des communautés microbiennes et fongiques de sols urbains au pied des tilleuls à petites feuilles en alignement dans les rues parisiennes	Institut d'Ecologie et des Sciences de l'Environnement. Sorbonne Université, Paris Diderot	Patricia GENET Séverine PLANCHAIS	31
Effet de la température, de la lumière et de l’origine géographique sur la production de toxines et de métabolites de Dinophysis sacculus	Laboratoire Phycotoxines (PHYC), IFREMER – Centre Atlantique, Nantes	Véronique SECHET Sylvain GAILLARD	32
Les microalgues marines en anoxie : diversité des métabolismes et interaction entre communautés	UMR Marbec (Marine Biodiversity Exploitation Conservation). Station Ifremer, Sète	Ariane ATTEIA	33
The use of genetic tools in order to understand how heterotrophic bacteria can cope under Fe-limitation	Laboratoire d’Océanographie Microbienne, Observatoire Océanologique de Banyuls	Stéphane BLAIN Coco KOEDOODER	34
STAGE POURVU			35
Les acides aminés dans la symbiose Alnus-Frankia, du métabolisme azoté au contrôle du symbiote ?	UMR 5557 Ecologie Microbienne, Université Lyon1	Anne-Emmabuelle HAY	36
Production du DMSP et de STXs en réponse à des variations de température et salinité chez A. minutum et A. catenella	Laboratoire Phycotoxines (PHYC), IFREMER – Centre Atlantique, Nantes	Amandine CARUANA Solène GEFFROY	37
Traits d’histoire de vie de différentes espèces de Botryosphaeriacea en France (résistance aux fongicides, mycovirus) : impact sur la fitness	INRA, UMR SAVE, 1065, 71 avenue E Bourlaux, CS 20032, 33882 Villenave d’Ornon cédex	Marie-France CORIO-COSTET	38
Mangroves : quels indicateurs microbiens pour la directive cadre sur l’eau (DCE) ?	Institut Méditerranéen d’Océanologie, Bâtiment Océanomed, Campus de Luminy, Marseille	Cécile MILITON Philippe CUNY	39
STAGE POURVU Réponse membranaire des bactéries Gram négatives aux conditions environnementales : évaluation des acides gras 3-hydroxylés comme marqueurs de température et de pH dans les sols	METIS Milieux environnementaux, Transferts et Interactions dans les hydrosystèmes et les Sols, Sorbonne Université	Sylvie COLLIN	40
Une communauté au sein d’une communauté: le cas du microbiote associé aux mouches des fruits de l’île de la Réunion	MNHN, UMR ISYEB	Nathalie BECKER	41
Détermination de la dynamique bactériologique en Marne	LEESU, Université Paris Créteil Est	Auréile JANNE	42
STAGE POURVU Development of a method to study growth limits of Listeria monocytogenes at low temperature	Anses, Laboratoire de sécurité des aliments de Maisons Alfort	Lena FRITSCH	43
Etude de l’influence du microbiote de l’huître Crassostrea gigas sur ses capacités immunitaire	Laboratoire des Interaction-Hôte-Pathogènes-Environnement, UMR5244, Perpignan	Céline COSSEAU Eve TOULZA	44
Evaluation du potentiel tératogène du glyphosate sur les diatomées benthiques d’eau douce	LIEC - Laboratoire Interdisciplinaire des Environnements Continentaux, UMR 7360 CNRS - Université de Lorraine, Metz	Martin LAVIALE Vincent FELTEN	45
Effet de la colonisation microbienne sur l'accumulation de métaux dans les mcroplastiques en milieu marin	Laboratoire MAPIEM -EA 4323- Ecologie microbienne & chimique des biofilms marins, Université de Toulon	Jean-François BRIAND	46
Effet de la durée d’exondation sur le microbiote de l’huître creuse, Crassostrea gigas	LEMAR, IUEM, Technopôle Brest-Iroise, Plouzané	Gwenaelle LEBLAY Clément OFFRET	47
Comparaison du Comportement trophique et de la Symbiose au cours du Développement chez les crevettes juvéniles entre Rimicaris exoculata et Rimicaris chacei	Laboratoire de Microbiologie des Environnements Extrêmes, Ifremer de Brest	Marie Anne CAMBON-BONAVITA Marie.Anne.Cambon @ ifremer.fr (Marie.Anne.Cambon @ ifremer.fr) Pierre METHOU Pierre.Methou @ ifremer.fr (Pierre.Methou @ ifremer.fr)	48
Exploration of the potential physiological functions of the SurR regulator at high pressures in Thermococcus barophilus MP	Laboratoire de microbiologie des environnements extrêmes LM2E, UMR6197, Ifremer (Centre de Brest), Institut Universitaire Européen de la Mer (IUEM/UBO)	Jordan HARTUINANS Yann MOLIC Mohamed JEBBAR	49
Genomics-guided chemical inverstigation of endophytic streptomyces for new antibiotic discovery	Unité Molécules de Communication et Adaptation des Microorganismes (MCAM), UMR 7245 CNRS/MNHN, Paris	Yanyan LI	50
STAGE POURVU Effet d’un traitement par faecalibacterium prausnizii sur les atteintes radio-induites du côlon: Potentialisation de l’effet thérapeutique des cellules stromales mésenchymateuses	IRSN - Institut de radioprotection et de sûreté nucléaire, LRMed - Laboratoire de radiobiologie des expositions médicales, Fontenay aux Roses	Alexandra SEMONT	51
Développement de nouveaux produits fermentés	Danone, Palaiseau		52
STAGE POURVU Inférence de la dynamique des populations de Mycobacterium tuberculosis et de son paysage adaptatif sur la base d'évolution expérimentale et de simulations prédictives	UMR 7205, ISYEB, Equipe Biologie Intégrative des Populations et Evolution Moléculaire, Museum National d'Histoire Naturelle - EPHE, Paris	Thierry Wirth	53
Etude d’association à l’échelle du génome du succès épidémique de souches de Mycobacterium tuberculosis multirésistantes impliquées dans des épidémies à large échelle	UMR 7205, ISYEB, Equipe Biologie Intégrative des Populations et Evolution Moléculaire, Museum National d'Histoire Naturelle - EPHE, Paris	Thierry Wirth	54
STAGE POURVU Analyse de l’infection virale par l’utilisation de la méthode du « Stable Isotope Probing » (SIP)	Irstea, unité de Recherche Hydrosystèmes et Bioprocédés, Antony	Ariane BIZE	55
Utilisation de la lumière visible dans le développement d’un procédé de décontamination	UMR PAM (Procédés Alimentaires et Microbiologiques) Equipe PMB, Agrosup Dijon	Sébastien DUPONT Cédric GRANGETEAU	56
Etude des bactériophages de produits cidricoles	Laboratoire MALIM (Matrices ALImentaires et Microbiotes), UR ABTE (Université de Caen Normandie,	Marion DALMASSO Marina CRETENET	57
Impacts de stress représentatifs des procédés sur l’activité fermentaire de bactéries intestinales, nouveaux microorganismes d’intérêt	Agrosup Dijon - UMR Procédés Alimentaires et Microbiologiques (PAM)	Veronique JULLIAND	58
Cinétique d’évolution des communautés microbiennes des sols de la Réunion suite à un apport répété de Produits Résiduaires Organiques	INRA Dijon / UMR Agroécologie / Equipe Biocom	Sophie BOURGETEAUSADET Frédéric FEDER	59
Exploration des « hot spots » microbiologiques dans les interfaces de mélange de fluides par imagerie microfluidique	Observatoire des Sciences de l’Univers de Rennes	Julien FARASIN	60
Interactions microbiennes pour la vitamine B12	Laboratoire GEPEA CRTT Saint Nazaire LPBA Ifremer	Anthony MASSÉ Charlotte NEF	61
Biodégradation de l’éthanolamine dans les bâches industrielles : compréhension des phénomènes microbiens en jeu	EDF - R&D - Laboratoire National d’Hydraulique et Environnement Groupe Chimie Microbiologie Eau et Environnement	Marie BINET	62
Evaluation de la productivité (croissance, photosynthèse, biomasse) de lignées génétiquement modifiées de lycopène cyclase d’ Ostreococcus tauri	Laboratoire d’Océanographie Microbienne, Observatoire Océanologique de Banyuls	François-Yves BOUGET	63
The rhizospheric microbial community of an endemic cushion of the Kerguelen Islands: Role in the plant adaptation to extreme environment and its response to climate changes	ECOBIO CNRS-UMR 6553, campus de Beaulieu Bât. 14 A, 35042 Rennes Cedex Rennes	Cecile MONARD	64
Rôle des microRNAs dans l’interaction plante-microbiome de la rhizosphère en condition de stress abiotique.	ECOBIO CNRS-UMR 6553, campus de Beaulieu Bât. 14 A, 35042 Rennes CedexRennes	Abdelhak EL AMRANI	65
Resistance of tardigrades to cyanotoxins	Muséum national d'Histoire Naturelle UMR 7196 INSERM U1154 "Structure et Instabilité des Génomes"	Emmanuelle DELAGOUTTE	66
Impact de la nutrition azotée de la plante sur les mécanismes de détoxication des formes actives de l'oxygène produites par un champignon Botrytis cinerea lors de l'infection	Institut Jean-Pierre Bourgin, INRA Centre de Versailles-Grignon, route de St Cyr, 78026 Versailles cedex	Marie-Christine SOULIE	67
STAGE POURVU Caractérisation fonctionnelle d’une diguanylate cyclase impliquée dans la formation de biofilms à l’interface alcane-eau par Marinobacter hydrocarbonoclasticus SP17	IPREM - UMR 5254 UPPA/CNRS IBEAS, Pau	Régis GRIMAUD	68

09/11/18

Traductions :