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Master 2 "Microbiologie, Environnement, Santé"
UPMC - MNHN

Propositions stages MES 2019-2020

Titre

Laboratoire

Responsable

Lien

Développement d’un ELISA permettant la détection spécifique des anticorps dirigés contre la protéine
VP2 du virus de la Fièvre Catarrhale Ovine de sérotype 4 (FCO ou Bluetongue

UMR de virologie 1161 ANSES-INRA-ENVA, Maison Alfort

Emmanuel BREARD

1

Bioconversion de la lignine par des consortia microbiens issus du microbiome intestinal des termites

Laboratoire d’Ingénierie des Systèmes Biologiques et des Procédés
LISBP – INSA Toulouse
Guillermina HERNANDEZ-RAQUET

2

Etude de la production des bioplastiques (polyhydroxyalcanoates) par des cultures mixtes microbiennesLaboratoire d’Ingénierie des Systèmes Biologiques et des Procédés
LISBP – INSA Toulouse
Guillermina HERNANDEZ-RAQUET3
Identification des partenaires protéiques de Hef impliqués dans le redémarrage de la réplication chez l'archée Haloferax volcanii

Laboratoire d’optique et biosciences, Ecole polytechnique, Palaiseau

Roxane LESTINI

4

Capture de microorganisme par culture haut débit

 GENPHYSE, INRA, 31320 AuzevilleOlivier ZEMB5

L’Orange Carotenoid Protein, une protéine modulaire et photoactive chez les cyanobactéries

I2BC, CEA Saclay Diana KIRILOVSKY6

STAGE POURVU

Impact de la Matière organique sur la structure des communautés microbiennes lacustres (analyses bio-informatiques et réseaux de co-occurrence)

UMR 7618 iEES-Paris, Sorbonne UniversitéJulie LELOUP 7

STAGE POURVU

Compétition inter-espèce pour le pouvoir pathogène : Qui gagne ? Qui se maintient ? Qui disparaît ?

UMR 7618 iEES-Paris, Sorbonne Université

Marie-Anne BARNY

Jacuqes PEDRON

 8

Approche multi-omique pour la compréhension des interactions entre Alexandrium et son microbiome

Laboratoire Phycotoxines, Ifremer, NantesEnora BRIAND9
Développement d’un système alliant cellules intestinales et bactéries commensales dans un système anaérobie afin améliorer la prédictivité des essais toxicologiques

ANSES, unité Toxicologie des contaminants, Fougères (35300)

Ludovic LE HEGARAT

 10

Etude comparative du photopériodisme sur des souches polaires, tempérées et tropicales de la
picoalgue Bathycoccus prasinos

Laboratoire d'Océanographie Microbienne, UMR 7621 CNRS-SU, Banyuls/mer

François-Yves BOUGET

 11

Le pathogène émergent Dickeya solani : comprendre son agressivité et lutter par biocontrôle

Institut de biologie intégrative de la cellule - I2BC, Gif-sur-Yvette

Denis FAURE

 12

Récurrence d’interactions biologiques entre protistes et bactéries dans le milieu marin côtier

Ifremer – Centre de Brest, 29280 Plouzané

Raffaele SIANO

13

Etat des lieux de la présence du parasite Cryptocotyle dans les produits de la pêche et de l'aquaculture : acquisition de données épidémiologiques et développement d'outils d'identification

Laboratoire de sécurité des aliments/ ANSES, Boulogne sur Mer

Mélanie GAY

14

Interactions entre microalgues et bactéries : influence de l’état physiologique et métabolique des microalgues sur la structuration des communautés bactériennes associées

Laboratoire DYNECO/PHYC - Centre Ifremer de Nantes

Enora BRIAND

15

Développement d’outils de surveillance de Bacillus thuringiensis dans l’alimentation

Laboratoire de Sécurité des Aliments (LSAl), Agence nationale de sécurité sanitaire, de l’environnement et du travail (Anses), Maison-Alfort Mathilde BONIS16

Chemotaxis in the Burkholderia insecticola – bean bug symbiosis

Institute of Integrative Biology of the Cell, Gif-sur-YvetteTsubasa OHBAYASHI,  Peter MERGAERT17

STAGE POURVU

Ecologie et biodiversité des bactérie magnétotactiques produisant des carbonates de calcium intracellulaires

UMR7265 BIAM, CEA Cadarache, 13108 St Paul lez Durance Christopher LEFEVRE 18
Identification et mise en évidence du rôle du microbiote dans la croissance de Nannochloropsis sp., une microalgue utilisée en aquaculture

MARBEC, Ifremer, IRD, Université de Montpellier, CNRS, Sète

GREENSEA, Parc Scientifique et Environnemental, Mèze

Angélique GOBET

Eric FOUILLAND

Adeline BECQUER

Jean-Paul CADORET

 19

Inhiber l’expression du gène csp21 chez l’amibe Acanthamoeba castellanii

Microbiologie de l’Eau, laboratoire EBI, UMR CNRS 7267, Poitiers

Ascel SAMBA

20

Diversité des communautés microbiennes et des particules virales au sein de méthaniseurs
industriels de déchets organiques

Irstea, UR PROSE (Procédés biotechnologiques au service de l’environnement), Antony Ariane BIZE 21

Métagénomique et diversité phylogénétique et fonctionnelle du phylum Bathyarchaeaota dans les sédiments marins profonds

Ifremer, Centre Bretagne de Plouzané dans le Laboratoire des Environnements Extrêmes (REM/EP/LM2E), Technopôle Brest-Iroise, Plouzané (Finistère). Laurent TOFFIN 22
Capteur pour la détection de Vibrio spp. dans les échantillons environnementaux

Laboratoire de Biodiversité et Biotechnologie Microbiennes, Observatoire Océanologique de Banyuls

 Julia BAUDART

 23

Solubilisation du nickel et du chrome dans les sols en Nouvelle-Calédonie : rôle de
l’activité bactérienne

Institut des sciences exactes et appliquées (ISEA), EA7484. Université de la Nouvelle-Calédonie

Hamid AMIR

24

Etude des mécanismes d’adaptation aux stress salin et métallique des plantes
halophytes de Nouvelle-Calédonie : applications à la bioremédiation des pollutions lagonaires.

Institut des sciences exactes et appliquées (ISEA), EA7484. Université de la Nouvelle-Calédonie

 Linda GUENTAS

25

Etude des mécanismes d’adaptation des plantes hyper-accumulatrices de métaux
néo-calédoniennes : focus sur les adaptations racinaires et rhizosphériques.

Institut des sciences exactes et appliquées (ISEA), EA7484. Université de la Nouvelle-Calédonie

Valérie BURTET-SARRAMEGNA

26

Impacts d’un poisson herbivore invasif sur les communautés microbiennes de l’environnement

MARBEC (UMR 9190) : Marine Biodiversity, Exploitation and Conservation, Montpellier

Sébastien VILLEGER

27

Rôle des poissons dans le maintien de la diversité fonctionnelle des micro-organismes en
milieu marin

MARBEC (UMR 9190) : Marine Biodiversity, Exploitation and Conservation, Montpellier

Arthur ESCALAS

28

 Kéfir et fermentations liquides

Structure et Instabilité des Génomes, CNRS UMR7196 / Muséum National d’Histoire Naturelle, 43 rue Cuvier 75005, Paris

 Jean-Baptiste BOULE, 

Christophe LAVELLE

 29

Interactions entre collemboles et champignons phytopathogènes : utilisation des phéromones

MNHN, UMR MECEDV, 1 Avenue du Petit-Château, 91800 Brunoy

 Sandrine SALMON

 30

Impact d’une plante hôte sur les interactions bactériennes : suivi de la production de métabolites secondaires bioactifs chez des bactéries en co-culture sous influence d’extraits végétaux

UMR CNRS 5557 Ecologie Microbienne - Université Lyon 1, Villeurbanne

 Gilles COMTE

 31

Development of isothermal amplification methods for diagnosis of arthropod-borne diseases of livestock

Laboratoire de Santé Animale – UMR BIPAR, Equipe Mitick, Groupe Vectotiq, Maisons-Alfort

 Sara MOUTAILLER

 32

STAGE POURVU

Nouvelles étapes d'ingénierie de cyanobactéries recombinantes pour augmenter leur production photosynthétique de terpènes (cosmétiques, biocarburants)

Laboratoire de Biologie et Biotechnologie des Cyanobactéries, CEA Saclay

Corinne CASSIER-CHAUVAT

 33

Caractérisation fonctionnelle d’une protéine d’intérêt de la souche bio-protectrice Lactococcus piscium CNCM I-4031

Oniris, Ecole Nationale Vétérinaire et de l'alimentation, NantesRaouf TAREB, Marie-France PILET 34

Etude d’association pangénomique du succès épidémique de souches de Mycobacterium
tuberculosis multirésistantes impliquées dans des épidémies à large échelle.

UMR 7205, Equipe BIPEM – ISYEB - MNHN, Equipe Biologie intégrative des populations et évolution moléculaire Thierry WIRTH35

STAGE POURVU

Développement de méthodologies de concentration/purification et de détection de
particules femto-planctoniques inédites 

UMR 6023 – Laboratoire Microorganismes : Génome et Environnement
Université Clermont Auvergne
 Jonathan COLOMBET36

Impact du changement global sur la structure et le fonctionnement
des communautés planctoniques hivernales en mer Méditerranée

Laboratoire d’Océanographie de Villefranche (UMR7093, CNRS/SU) Frédéric GAZEAU37
Étude de l’écosystème microbien d’un environnement extrême : les sources hydrothermales volcaniques l'île de Vulcano (Italie)

Institut Méditerranéen d’Océanologie, Campus de Luminy, Marseille

 Gael ERAUSO

38

The microbiological terroir of vine plants : a biogeographic analysis

Université de Rennes 1, CNRS, UMR6553 ECOBIO.

Marine BIGET

39

Régulation de la production des métabolites secondaires chez la cyanobactérie Nostoc sp. exposée à différentes conditions de culture

 Muséum National d’Histoire Naturelle, UMR MCAM Sandra KIM TIAM 40
Impacts de la phylogénie et du régime alimentaire sur la composition du microbiote desoiseaux du Paléarctique Ouest

Institut de Systématique, Évolution, Biodiversité. UMR7205 ISYEB, MNHN, Paris

 Jérôme FUCHS

 41

Interaction bacteria – viruses in soil: Response to soil water content and consequences on soil organic carbon dynamic

Université de Rennes 1, CNRS, UMR6553 ECOBIO.Cécile MONARD, Achim QUAISER 42

 

   

 

   

20/09/19

Traductions :