Les microorganismes constituent des acteurs majeurs dans le fonctionnement des écosystèmes et dans la santé humaine et animale au sein des microbiotes. Ces microorganismes restent malgré tout encore largement méconnus. L’identification de nouvelles espèces de bactéries, archées, virus ou eucaryotes unicellulaires, la description  taxonomique et fonctionnelle des communautés microbiennes et de leur dynamique en réponse à des modifications de leur environnement, l’étude de leur interactions biotiques (ex. quorum sensing), la découverte de nouvelles biomolécules d’intérêt biotechnologique et l’utilisation des microorganismes dans différents bioprocédés, constituent des axes importants de la recherche en microbiologie fondamentale et appliquée.

La thématique Microbiologie-Environnement-Santé (MES) se place à l’interface Microorganismes-Environnement autour du concept « One Health » liant la santé des écosystèmes à celle de l’Homme. Cette formation vise à répondre aux attentes des laboratoires académiques et des entreprises dans les domaines de :

• L’étude des microorganismes des écosystèmes naturels et des microbiotes,
• L’évaluation des risques sanitaires liés aux microorganismes,
• La valorisation des microorganismes dans l’industrie,
• Le diagnostic environnemental et les techniques de bioprocédés et de bioproductions.

La thématique MES offre une formation transversale de haut niveau permettant d’aborder la biodiversité des microorganismes, les approches omiques appliquées à l’étude de modèles microbiens et des communautés microbiennes, la caractérisation des biomolécules microbiennes et l’écotoxicologie microbienne.

La thématique MES bénéficie :

i) d’une complémentarité de compétences des enseignantes-chercheuses et enseignants-chercheurs de Sorbonne Université et du Muséum National d’Histoire Naturelle dans le domaine de la microbiologie et de la chimie microbienne (incluant les microorganismes eucaryotes), de sa diversité et de son impact sur les écosystèmes (eau et sol principalement),

ii) de l’utilisation de plateformes analytiques performantes à l’Observatoire Océanologique de Banyuls et au MNHN de Paris,

iii) de l’intervention de professionnels dans le domaine de la valorisation de biomolécules microbiennes et l’évaluation du risque sanitaire dans l’environnement.

Cette formation est proposée à des étudiants inscrits à SU et au MNHN avec une nomenclature qui est spécifique à chaque établissement et qui est la suivante :

SU - Master "Sciences & Technologie & Santé" / Mention "Biologie Moléculaire et Cellulaire" / Parcours "Microbiologie" / Thématique "Microbiologie Environnement Santé"

MNHN - Master "Evolution, Patrimoine Naturel et Sociétés" / Spécialité "Mécanismes du Vivant et Environnement" / Parcours "Microbiologie Environnement Santé"

Mots-clefs :

Microbiologie, biodiversité, génomique, écologie chimique. environnement, santé humaine et animale, bioremédiation, écotoxicologie, biotechnologie, valorisation.